jquery.cookie.jsでCookie情報が消えない

それはもしかしたらパスが異なっていて、同じ名前のCookieがパス毎に複数できているからかもしれない

パスを指定しよう
※有効期限も設定しないと、期限切れで、値が有効にならない場合がある。

$.cookie("pc-mode", "pc", { expires: 7, path: "/" });

ちなみにcookieの消し方は

jquery.cookie.jsのCookie(クッキー)を削除する3つの方法 | iwb.jp